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Esto era un correo para un compañero de la universidad pero creo que vale la pena dejarlo como referencia:

Hola, el micro que yo tengo es este:

http://www.atmel.com/dyn/products/product_card.asp?PN=ATmega8535

buscando en youtube:
http://www.youtube.com/watch?v=81DjwWqE6Iw&feature=related

Algo sobre atmel y linux
http://linux.org.ar/pipermail/bblug/2006-September/000666.html
http://superpositioned.com/2006/04/14/getting-started-with-the-amtel-avr

Este resumen está interesante:
http://pramode.net/articles/lfy/atmega8/pramode.html

El programador
* este es el que más me gustó:
http://stengaard.net/anders-s/HOPE/AVR_ISP/avr_isp.html
* este es el de atmel en el que se basan el anterior y la mayoría:
http://www.atmel.com/dyn/Products/tools_card.asp?tool_id=2726
* Este no requiere conversor paralelo/usb:
http://www.e.kth.se/~joakimar/hardware.html
* Este es el MAS BARATO:
http://www.qsl.net/ba1fb/avrisp.gif
http://my.opera.com/CrazyTerabyte/blog/2007/10/26/first-contact-with-atmega8-microcontroller-part-2
* Ya hechos:
http://store.gravitech.us/avrusbinciem.html
http://www.active-robots.com/products/accessories/pololu-orangutan-usb-programmer.shtml
* este es solo un cable pero no se si sirve para el mio:
http://pinguin.sauerland.de/cat5.html

Doc de la librería de c:http://www.nongnu.org/avr-libc/user-manual